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政府债务
个别地区政府偿债困难
审计报告指出，个别地方政府性债务偿债压力较大。至2013年6月底，全国地方政府负偿还责任的债务中，需在2015年偿还的有1.86万亿元（占17%）。重点抽查的9个省本级、9个省会城市本级和9个县，2014年底政府负偿还责任债务余额比2013年6月底增加46%；今年以来增速放缓，3月底比年初增长0.1%（县级下降3.5%），但这些地区上年综合财力呈负增长的有三分之一，大部分地方政府债券尚未发行，个别地区债务偿还出现困难。
这次的审计工作报告反映出地方政府性债务今年以来增速下降，但个别地方偿债出现困难。
审计署政策研究室相关负责人表示，从今年的跟踪审计情况看，2013年6月底以来，政府性债务呈现两个特点，一方面是2014年底比2013年6月底增幅加大；另一方面是今年3月底与去年同期相比增长明显放缓，县级还有所下降。
税费收缴
6地国税违规延压税款159亿
审计报告指出，征管不严造成税收流失。2013年至2014年，6个省区市的国税部门违规批准延期申报、缓缴、暂存过渡户等延压税款159.64亿元，其中2014年20.32亿元；10个省区市的国税部门纳税审核不严，少征37家企业税款3.18亿元；还有15个省区市的国税部门违规为104家企业办理税收减免5亿元。
发票监管方面，药品购销领域偷逃税仍较突出。抽查的65家企业虚开药品销售发票200多亿元，偷逃税60多亿元。税务机关对其中36家企业从未进行过稽查，对其他29家企业的稽查也不到位。有的企业是专门的开票公司，如辽宁省黑山县周宗武等人两年间在不足50平方米的同一场所重复注销、开设6家企业，涉嫌向100多家医药企业虚开增值税专用发票30多亿元。
专家观点
问题资金多缘于审计力度大
对于2015年审计工作报告，中国社科院财经战略研究院财政审计研究室主任汪德华认为，报告点出了6个省区市的国税部门违规批准延期申报、缓缴、暂存过渡户等延压税款约160亿元，土地出让收入少征3664亿元等突出问题。“从中可以发现，今年报告中指出的问题更为尖锐，违规金额更多。”
汪德华解释，事实上，违规金额更多，主要是因为审计机关依法履行审计监督的工作力度更大、技术手段更先进。在2015年的审计工作报告中，对专项资金的审计往前延伸了几年，许多违规问题是以前年度的，比如土地出让收支和耕地保护审计的是2008年至2013年的情况。同时，按照审计全覆盖的要求，审计范围进一步扩大。因此，审计发现违规金额更多，并非反映当前财经秩序更差了，而应是审计力度大大加强的结果。
汪德华认为，报告的一大亮点是审计工作报告的宽度和广度。今年审计工作报告的一个重要变化，是首次对中央决算草案进行了全面审计。虽然去年的审计工作报告就已提出审计了2013年中央财政决算草案总体情况。但今年审计工作报告重点表述了中央决算草案审计的情况和发现的问题，在第一部分中不仅指出了当前中央决算草案报表体系不够完善、重要事项披露不够充分的问题，还指出了中央决算草案与中央部门决算草案衔接不够好。 | 
